Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E4f1Q8CCE9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E4f1Q8CCE9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms