Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc15Q8C9M2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms