Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc22Q8C5N3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms