Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcl3Q8BVF2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcl3Q8BVF2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms