Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop53Q8BK35 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nop53Q8BK35 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nop53Q8BK35 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nop53Q8BK35 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop53Q8BK35 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop53Q8BK35 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop53Q8BK35 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop53Q8BK35 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop53Q8BK35 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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