Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4dQ8BGV9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms