Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms