Protein–RNA interactions for Protein: Q810P2

Odf3l1, Outer dense fiber protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3l1Q810P2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3l1Q810P2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf3l1Q810P2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms