Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LRRC9Q6ZRR7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
LRRC9Q6ZRR7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms