Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPPA3Q6W0C5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPPA3Q6W0C5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms