Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms