Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr44Q6NVE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr44Q6NVE8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms