Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2surpQ6NV83 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
U2surpQ6NV83 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms