Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retreg2Q6NS82 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retreg2Q6NS82 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retreg2Q6NS82 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms