Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp4eQ66X19 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp4eQ66X19 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms