Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt12Q64291 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt12Q64291 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms