Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhocQ62159 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhocQ62159 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhocQ62159 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhocQ62159 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhocQ62159 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms