Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb6Q60692 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms