Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF38BQ5VTL8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms