Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc125Q5U465 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc125Q5U465 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms