Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme4Q5SSW2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psme4Q5SSW2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms