Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Mdc1Q5PSV9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mdc1Q5PSV9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdc1Q5PSV9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms