Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc1Q5NCF2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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