Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil2Q3V3V9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil2Q3V3V9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms