Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc27Q3V036 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc27Q3V036 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms