Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C87499Q3UX49 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87499Q3UX49 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms