Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BB287469Q3UT53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217 ms