Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc106Q3ULM0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms