Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Babam1Q3UI43 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Babam1Q3UI43 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170 ms