Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy4Q3TYX8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy4Q3TYX8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms