Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc10Q3TLI0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms