Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Specc1lQ2KN98 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1lQ2KN98 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms