Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd11Q1RNF8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd11Q1RNF8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms