Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRF1Q16656 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRF1Q16656 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRF1Q16656 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRF1Q16656 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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NRF1Q16656 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NRF1Q16656 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NRF1Q16656 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRF1Q16656 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NRF1Q16656 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRF1Q16656 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRF1Q16656 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRF1Q16656 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRF1Q16656 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRF1Q16656 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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