Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ASPH-212ENST00000518306 755 ntTSL 58.18□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 31.2
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PCBP1Q15365 ASPH-223ENST00000522349 531 ntTSL 56.92□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-228ENST00000523927 556 ntTSL 46.15□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ASPH-210ENST00000517928 548 ntTSL 45.96□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 31.2
PCBP1Q15365 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 54.17□□□□□ -1.745e-12■■■■■ 31.2
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PCBP1Q15365 TKFC-219ENST00000534084 964 ntTSL 313.86□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 31.1
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PCBP1Q15365 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-203ENST00000518168 1013 ntTSL 221■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 31.1
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PCBP1Q15365 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)19.17■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 31.1
PCBP1Q15365 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-69■■■■■ 31
PCBP1Q15365 CALR-204ENST00000586967 394 ntTSL 216.24■□□□□ 0.195e-69■■■■■ 31
PCBP1Q15365 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 213.25□□□□□ -0.295e-69■■■■■ 31
PCBP1Q15365 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.29e-8■■■■■ 31
PCBP1Q15365 MBD6-214ENST00000552659 530 ntTSL 313.86□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.795e-10■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 DNAJC4-208ENST00000540945 703 ntTSL 220.31■□□□□ 0.845e-10■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.715e-10■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.55e-10■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 217.12■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 TRIP10-212ENST00000600677 2022 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 30.9
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PCBP1Q15365 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.15e-10■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 DNAJC4-204ENST00000535246 502 ntTSL 315.34■□□□□ 0.055e-10■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 TRIP10-203ENST00000595305 2068 ntTSL 215.27■□□□□ 0.035e-10■■■■■ 30.9
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PCBP1Q15365 TRIP10-209ENST00000598843 469 ntTSL 214.94□□□□□ -0.025e-10■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.025e-10■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 30.9
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PCBP1Q15365 CORO7-208ENST00000571227 3578 ntTSL 512.01□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CAMTA2-203ENST00000381311 4374 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CSK-205ENST00000563894 1036 ntTSL 1 (best)21.65■■□□□ 1.061e-17■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.731e-17■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 30.9
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PCBP1Q15365 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-23■■■■■ 30.9
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PCBP1Q15365 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-23■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 ANO10-201ENST00000292246 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-23■■■■■ 30.9
PCBP1Q15365 ATXN2L-219ENST00000566007 471 ntTSL 310.17□□□□□ -0.783e-16■■■■■ 30.8
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PCBP1Q15365 MMP24-AS1-204ENST00000438751 670 ntTSL 319.1■□□□□ 0.652e-14■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-14■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 MMP24-AS1-202ENST00000433764 569 ntTSL 418.81■□□□□ 0.62e-14■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 MMP24-AS1-208ENST00000456350 634 ntTSL 418.71■□□□□ 0.592e-14■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 MMP24-AS1-206ENST00000454184 547 ntTSL 418.51■□□□□ 0.552e-14■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-14■■■■■ 30.8
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PCBP1Q15365 MMP24-AS1-203ENST00000435366 1499 ntTSL 217.35■□□□□ 0.372e-14■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 MMP24-AS1-207ENST00000455178 395 ntTSL 517.2■□□□□ 0.342e-14■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 MMP24-AS1-212ENST00000635104 1227 ntTSL 513.4□□□□□ -0.262e-14■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -04e-9■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.178e-16■■■■■ 30.8
PCBP1Q15365 ATXN2L-222ENST00000567024 525 ntTSL 319.31■□□□□ 0.685e-24■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 SRRM2-206ENST00000571041 498 ntTSL 416.96■□□□□ 0.311e-53■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 SRRM2-204ENST00000570705 675 ntTSL 316.84■□□□□ 0.291e-53■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.143e-9■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-29■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 316.86■□□□□ 0.291e-10■■■■■ 30.6
PCBP1Q15365 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.252e-9■■■■■ 30.6
PCBP1Q15365 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 30.6
PCBP1Q15365 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 30.5
PCBP1Q15365 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 214.63□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 30.5
PCBP1Q15365 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 30.5
PCBP1Q15365 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 30.5
PCBP1Q15365 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-11■■■■■ 30.5
PCBP1Q15365 ZYX-207ENST00000457235 703 ntTSL 428.47■■■□□ 2.156e-8■■■■■ 30.5
PCBP1Q15365 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 212.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 30.5
PCBP1Q15365 CR1L-203ENST00000508064 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.779e-10■■■■■ 30.4
PCBP1Q15365 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 30.3
PCBP1Q15365 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 30.3
PCBP1Q15365 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 30.3
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