Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ptchd1Q14B62 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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