Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS1Q14651 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS1Q14651 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms