Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSHL1Q14406 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms