Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4AQ13619 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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