Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCOCO2Q13137 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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