Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 ECHDC2-202ENST00000371520 1606 ntTSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.793e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-211ENST00000480312 804 ntTSL 517.67■□□□□ 0.423e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-208ENST00000476477 1676 ntTSL 217.34■□□□□ 0.373e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-204ENST00000460612 2645 ntTSL 217.07■□□□□ 0.323e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-226ENST00000544531 548 ntTSL 416.88■□□□□ 0.293e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-223ENST00000542552 981 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.193e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.153e-8■□□□□ 9.2
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GRSF1Q12849 ECHDC2-207ENST00000474789 545 ntTSL 313.21□□□□□ -0.293e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 212.03□□□□□ -0.483e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 511.98□□□□□ -0.493e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 ECHDC2-216ENST00000488268 631 ntTSL 311.23□□□□□ -0.613e-8■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 FBXO31-208ENST00000636077 660 ntTSL 522.98■■□□□ 1.272e-11■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-11■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 519.67■□□□□ 0.742e-11■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 515.19■□□□□ 0.022e-11■□□□□ 9.2
GRSF1Q12849 DNAJB2-210ENST00000472019 1419 ntTSL 326.03■■□□□ 1.763e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.523e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 220.03■□□□□ 0.83e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 418.44■□□□□ 0.543e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-210ENST00000576925 611 ntTSL 218.44■□□□□ 0.543e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.393e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 316.35■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 216.17■□□□□ 0.183e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 DNAJB2-213ENST00000477917 4487 ntTSL 215.45■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.433e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 CAPRIN2-205ENST00000454014 4398 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-6■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 NFE2L1-212ENST00000581319 481 ntTSL 310.17□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 9.1
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GRSF1Q12849 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.639e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.59e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-218ENST00000483629 1818 ntTSL 517.77■□□□□ 0.449e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.389e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.359e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.349e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-221ENST00000610553 2300 ntTSL 216.94■□□□□ 0.39e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 216.83■□□□□ 0.289e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.179e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.119e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 EWSR1-216ENST00000479135 7285 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.489e-13■□□□□ 9.1
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GRSF1Q12849 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.659e-13■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.759e-13■□□□□ 9.1
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GRSF1Q12849 FASTK-215ENST00000489884 1751 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.132e-8■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-8■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-8■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.82e-8■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-8■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 FASTK-204ENST00000460980 1521 ntTSL 516.24■□□□□ 0.192e-8■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 29.1□□□□□ -0.952e-8■□□□□ 9.1
GRSF1Q12849 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 225.89■■□□□ 1.744e-16■□□□□ 9
GRSF1Q12849 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.411e-7■□□□□ 9
GRSF1Q12849 MTHFD2-204ENST00000462026 599 ntTSL 511.48□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 9
GRSF1Q12849 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 9
GRSF1Q12849 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.941e-7■□□□□ 9
GRSF1Q12849 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 29.08□□□□□ -0.961e-7■□□□□ 9
GRSF1Q12849 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 28.85□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 9
GRSF1Q12849 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.221e-9■□□□□ 9
GRSF1Q12849 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.221e-9■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.924e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-204ENST00000372157 855 ntTSL 520.73■□□□□ 0.914e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.914e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.914e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.714e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-9■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-208ENST00000469149 959 ntTSL 218.62■□□□□ 0.574e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.774e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.384e-6■□□□□ 9
GRSF1Q12849 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.993e-15■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-15■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 ASGR1-206ENST00000573596 2083 ntTSL 517.91■□□□□ 0.463e-15■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 ASGR1-203ENST00000570576 627 ntTSL 512.94□□□□□ -0.343e-15■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 ASGR1-205ENST00000573083 855 ntTSL 310.5□□□□□ -0.733e-15■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-245ENST00000484556 1038 ntTSL 219.75■□□□□ 0.751e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 417.83■□□□□ 0.441e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-231ENST00000417521 1479 ntTSL 517.28■□□□□ 0.361e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-244ENST00000482873 2673 ntTSL 515.13■□□□□ 0.011e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.561e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.581e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-5■□□□□ 8.9
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