Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PepdQ11136 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PepdQ11136 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PepdQ11136 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PepdQ11136 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms