Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc138Q0VF22 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc138Q0VF22 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms