Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cib3Q0P523 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms