Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNA1Q09470 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms