Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r236Q05A06 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r236Q05A06 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms