Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfdn6Q03958 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfdn6Q03958 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms