Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoa1Q00623 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apoa1Q00623 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apoa1Q00623 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms