Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2C1P98194 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2C1P98194 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms