Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RptnP97347 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RptnP97347 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RptnP97347 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RptnP97347 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RptnP97347 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RptnP97347 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RptnP97347 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RptnP97347 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RptnP97347 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RptnP97347 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RptnP97347 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RptnP97347 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RptnP97347 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RptnP97347 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RptnP97347 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RptnP97347 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RptnP97347 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RptnP97347 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RptnP97347 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms